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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: http://hdl.handle.net/10990/41

Autori: Giacomello, Stefania
Supervisore afferente all'Università: MORGANTE, MICHELE
Centro di ricerca: DIPARTIMENTO SCIENZE AGRARIE E AMBIENTALI - DISA
Titolo: Next-generation sequencing in Populus nigra: de novo assembly, genome-wide SNP map and comparative genomic analysis
Abstract: Il progetto di dottorato è suddiviso in due parti. Entrambe riguardano l’applicazione della tecnologia Illumina per l’analisi del genoma di Populus nigra. Nella prima parte è stato usato l’approccio di reference assembly per l’individuazione di polimorfismi a singolo nucleotide da utilizzare in analisi di genetica di popolazione e la produzione di uno SNP chip. Nella seconda parte è stato usato l’approccio di "de novo assembly" per ricostruire il genoma di Populus nigra e poter eseguire delle analisi di genomica comparativa tra il genoma della specie in questione e quello di Populus trichocarpa.
Parole chiave: Populus nigra; Illumina next-generation sequency; Reference assembly; de novo assembly; Genome difference; Populus trichocarpa; SNP map; Genome-wide
MIUR : Settore BIO/18 - Genetica
Lingua: eng
Data: 29-mar-2012
Corso di dottorato: Dottorato di ricerca in Scienze e biotecnologie agrarie
Ciclo di dottorato: 24
Università di conseguimento titolo: Università degli Studi di Udine
Luogo di discussione: Udine
Altre informazioni: Co-supervisore: Giusi Zaina
Citazione: Giacomello, S. Next-generation sequencing in Populus nigra: de novo assembly, genome-wide SNP map and comparative genomic analysis. (Doctoral Thesis, Università degli Studi di Udine, 2012).
In01 - Tesi di dottorato

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